车辆被扣后如何进行年审，需要根据具体情况采取相应措施：

车辆未年检被扣

督促当事人期限内对机动车进行补检，同时可以对机动车驾驶人处以200元罚款，记3分。

车辆因法院查封被扣

需要提供法院提供的证明和凭证才能进行年检。

车辆因事故未处理被扣

需要先处理完毕违章记录，然后才能进行年审。

车辆长期在外地执行任务不能按期参加检验

由车主提出申请，报经原籍车管所委托驻地车管所代为检验，检验后将结果通知原籍车管所。

车辆因特殊情况不能按期参加年检

应事先向当地车管所申请延期。

车辆被锁定

仍然可以正常年审，但需要携带身份证、行驶证以及交强险副本，到检测站填写相关申请表和记录表，查询并处理违章记录，进行车辆外观和内部检测，最后领取年检标志。

总结来说，被扣车的年审流程需要根据车辆的具体情况来处理，包括补检、提供法院证明、处理违章记录、委托异地检验或申请延期等步骤。建议车主尽早处理相关手续，以免影响年审进度和车辆使用。