施工许可证由工程所在地的县级以上人民政府建设行政主管部门负责办理。根据《中华人民共和国建筑法》的相关规定，建设单位在建筑工程开工前应向当地的建设行政主管部门申请领取施工许可证。这一制度旨在确保施工活动的合法性和规范性，保障建筑工程的质量和安全