休学后的档案通常存放在学校的学生档案管理部门，也就是学校的档案馆。以下是具体的信息：

休学是学生因故暂时中断学籍注册的一种状态，因此休学档案是学生档案的一部分。

在学生休学期间，档案继续由学校保管。

休学结束后，如果学生复学，档案会随之转移回学生手中；如果学生毕业，档案通常也会由学校转寄到学生毕业后的目的地，如新的学校或工作单位等。

对于大学生而言，如果主动退学，应向学校学籍档案管理部门提出书面申请，以便将自己的学籍档案转寄到指定位置。

请注意，不同学校可能会有不同的具体操作流程，建议直接咨询您所在的学校了解详细的档案处理流程